计算机集群使用快速入门手册
计算机集群的IP是:10.112.60.136，此地址可能变化。
上传下载文件：WinSCP，或者其它ftp软件。
命令行登陆: putty.exe
VNC-Viewer（根据系统选择32位或64位），不用安装，用来远程登陆集群的图形界面（相当于windows的远程桌面，限3人同时使用）。
注意：长时间计算请不要使用图形界面登录。
常用命令
ls：显示当前目录下的文件和文件夹
dir：同ls
cd：改变目录
passwd：更改当前用户的密码。注意，本系统对密码的要求较高，请设置复杂一些的密码。
ifort *.f90：编译*.f90文件为可执行文件，默认输出文件名为a.out，也可自行指定输出文件名。
ifort –o name *.f90：编译*.f90文件为可执行文件，指定输出的可执行文件名为name。
./a.out：直接执行a.out文件。注意这样执行的文件在你退出putty软件时也同时停止运行了。注意：这种方式的执行程序是直接在管理节点上运行程序，只能测试时使用，不可执行长时间的运算。如需长时间计算，请按照作业提交的方式执行。
logout：退出连接.
ctr+d：退出连接，推荐使用ctr+d退出连接。
作业提交
创建作业脚本文件.
比如，要运行前面编译好的a.out程序，可新建一个“test”文件，包含该程序的绝对路径，
/export/home/yanghj/a.out
注意：作业脚本的编辑可以在windows新建一个txt文本，然后把后缀txt删掉来建立。也可以用linux下的vi编辑器来创建。并行程序的脚本编辑参见用户手册。
提交作业.
用qsub命令提交作业，
qsub test
注意，用上述命令的意思是，提交当前目录下的test脚本，但程序运行的默认目录为当前用户的根目录，在程序中需要读取和输出的文件等都会存放在根目录中，但程序运行完成后，作业的输出文件和错误文件会保存到当前目录。
如果希望指定程序运行的默认目录，比如要执行的脚本test和其它文件都要放在pendulum目录下,则应该在根目录下提交如下命令
qsub –d pendulum test
提交作业后，可用” qstat”来查看作业的运行状态。
[yanghj@console ~]$ qstat
Job id Name User Time Use S Queue
------------------- ---------------- --------------- --------- -----
351.console test1 yanghj 00:05:14 R dpool
删除作业”qdel”
$ qdel 351
查看作业输出文件（作业运行结束后）
作业输出文件一般为”test.o351”，可使用”cat、less”等命令查看，如
cat test.o351 或者 less test.o351
查看完毕后，按“q”键退出。
也可以在qsub命令后加参数“-j oe”将输出文件和错误文件合并。
vi编辑器使用简介
vi编辑器是所有Unix及Linux系统下标准的编辑器。基本上vi可以分为三种状态，分别是命令模式（command mode）、插入模式（Insert mode）和底行模式（last line mode）。
$ vi test
上述命令可以新建一个test文件，也可以打开原有的文件。命令执行后，vi编辑器处于命令模式下，此时不能编辑文字。按“i”键，即可进入插入模式编辑文件。文件编辑好后，可按“ESC”键进入命令模式，输入“:wq”或“:x”可退出并保存文件，输入“：q！”则退出但不保存文件。
用网页提交作业
用网页登陆到集群系统，可上传文件，新建文件目录，提交作业等，参见用户手册。
注意：在网页上新建串行脚本时，最后会提示未知错误，但并不影响使用，仍然可提交作业。也可自己编辑脚本文件。
5. VNC Viewer使用简介
在Linux操作系统最流行的图形化操作软件是VNC,正如windows下的mstsc远程桌面，在大多数 Linux 发行版都带了 VNC Server 的发行包.使用时先启动远程客户端，然后用VNC Viewer连接。
5.1 用putty软件登录linux，运行 vncserver 命令，启动1个服务端，会分配1个桌面号，默认是从1开始。多次运行可启动多个桌面。本服务器默认开启1-50端口，如需更多连接，请和管理员联系。如果第一次配置 VNC Server，会要求设置登录 VNC 使用的密码。也可以使用 vncpasswd 来修改密码。
然后，用vi编辑器（使用说明见3.5，也可以在winscp软件中右键编辑，比较简单）打开.vnc目录下的xstartup文件，其内容如下，删除第3、4行前的“#”，然后保存文件，结果如下：
#!/bin/sh
# Uncomment the following two lines for normal desktop:
unset SESSION_MANAGER
exec /etc/X11/xinit/xinitrc
[ -x /etc/vnc/xstartup ] && exec /etc/vnc/xstartup
[ -r $HOME/.Xresources ] && xrdb $HOME/.Xresources
xsetroot -solid grey
vncconfig -iconic &
xterm -geometry 80x24+10+10 -ls -title "$VNCDESKTOP Desktop" &
twm &
配置好后，需要重启桌面，运行vncserver –kill :3命令可以关闭刚才的桌面（桌面号按自己的设置），然后再用vncserver命令再开一个桌面。
5.2在 Windows 使用 VNC Viewer 登录了（无需安装，直接运行，注意根据你的操作系统选择32位或64位）
输入服务器地址：10.112.60.136:3（桌面号按自己的设置）
然后提示输入密码，输入你刚才设定的密码，就可以看到远程桌面了，如下图所示.
本集群上安装了Matlab2012b，如果经常使用，可在桌面上建立快捷方式。在桌面上点右键，选择“Create Lancher”,在弹出的对话框中type选择“Application in Terminal”，name自己选，如“matlab2012”，Command中选择matlab的安装位置，“/usr/local/MATLAB/R2012b/bin/matlab”。确定后，就可以运行matlab了。
5.3 在windows端关闭VNC Viewer，桌面仍然在，只要服务器端不停止桌面，再次登录后可看到运行的程序也还在执行。
程序执行完毕，需要关闭桌面时（让其他人使用），用putty软件登录并运行vncserver -kill命令。注意：关闭桌面后用这个桌面运行的程序也会关闭。
[root@localhost ~]#vncserver -kill :3
